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具槽帕拉藻代谢组提取方法的比较研究
Alternative TitleComparison of metabolome extraction strategies from Paralia sulate
于倩; 王清; 韩伟; 张倩; 吴惠丰; 赵建民; 赵建民,中国科学院烟台海岸带研究所中国科学院海岸带环境过程与生态修复重点实验室,Email:jmzhao@yic.ac.cn; 吴惠丰,中国科学院烟台海岸带研究所中国科学院海岸带环境过程与生态修复重点实验室,Email:hfwu@yic.ac.cn
2015-12-15
Source Publication海洋通报
ISSN1001-6392
Volume34Issue:6Pages:703-709
Contribution Rank中国科学院烟台海岸带研究所中国科学院海岸带环境过程与生态修复重点实验室;中国科学院大学;山东省寿光市海洋与渔业局;中国农业大学烟台研究院;
Abstract代谢组学技术已被广泛应用于环境科学、生物医学、营养学等众多研究领域。以海洋环境指示物种具槽帕拉藻(Paralia sulate)为研究对象,采用两种细胞破碎方式和三种溶剂系统对均一生物样本的代谢物进行提取,结合核磁共振(Nuclear magnetic resonance,NMR)波谱分析和主成分分析(Principal components analysis,PCA),对不同的代谢物提取系统进行了评估。结果表明:甲醇/水(1∶1)与匀浆相结合的方法具有高提取产率、高重现性、易操作和速度快等特性,是适合具槽帕拉藻代谢物提取的方法,可为后续代谢途径的研究提供参考。
Other AbstractMetabolomics has been applied in multiple fields, including environmental sciences, biomedicine, and nutriology. In the present study, the metabolites of Paralia sulate are extracted by using three solvent extraction systems and two ways of cell disruption, and then they are assessed with one dimensional proton nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy combined with principal components analysis (PCA). It is found that the extraction strategy of methanol/water (1 ∶ 1, homogenized) is preferable for the metabolite extraction due to its highest yield, reproducibility, ease and speed. Validation of extraction protocol provides a reference for further detection of metabolic pathway of P. sulate.
Keyword代谢组学 代谢物提取 Nmr 具槽帕拉藻(Paralia Sulate)
Department中科院海岸带环境过程与生态修复重点实验室
DOI10.11840 / j.issn.1001-6392.2015.06.013
Funding Organization中国科学院战略性先导科技专项(A类)(XDA11020405)
Indexed ByCSCD
Subtype期刊论文
Language中文
CSCD IDCSCD:5621912
Citation statistics
Document Type期刊论文
Identifierhttp://ir.yic.ac.cn/handle/133337/17351
Collection中科院海岸带环境过程与生态修复重点实验室
Corresponding Author赵建民,中国科学院烟台海岸带研究所中国科学院海岸带环境过程与生态修复重点实验室,Email:jmzhao@yic.ac.cn; 吴惠丰,中国科学院烟台海岸带研究所中国科学院海岸带环境过程与生态修复重点实验室,Email:hfwu@yic.ac.cn
Affiliation1.中国科学院烟台海岸带研究所中国科学院海岸带环境过程与生态修复重点实验室
2.中国科学院大学
3.山东省寿光市海洋与渔业局
4.中国农业大学烟台研究院
Recommended Citation
GB/T 7714
于倩,王清,韩伟,等. 具槽帕拉藻代谢组提取方法的比较研究[J]. 海洋通报,2015,34(6):703-709.
APA 于倩.,王清.,韩伟.,张倩.,吴惠丰.,...&吴惠丰,中国科学院烟台海岸带研究所中国科学院海岸带环境过程与生态修复重点实验室,Email:hfwu@yic.ac.cn.(2015).具槽帕拉藻代谢组提取方法的比较研究.海洋通报,34(6),703-709.
MLA 于倩,et al."具槽帕拉藻代谢组提取方法的比较研究".海洋通报 34.6(2015):703-709.
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