海岸带沉积物中氮循环功能微生物多样性

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	海岸带沉积物中氮循环功能微生物多样性
其他题名	Phylogenetic and functional diversity of nitrogen cycling microbes in coastal sediments
	龚骏 ; 宋延静 ; 张晓黎
发表期刊	生物多样性
ISSN	1005-0094
	2013-07-15
卷号	21 期号:4 页码:434-445
关键词	分子生态功能基因多样性海洋底栖生物群落组成物种多样性系统分类
产权排序	中国科学院烟台海岸带研究所微生物生态与物质循环实验室;中国科学院大学;
通讯作者	龚骏 E-mail:jgong@yic.ac.cn
作者部门	海岸带生物学与生物资源利用所重点实验室
英文摘要	海岸带生境类型多样,环境梯度明显,是研究微生物多样性、群落结构与功能关系及调控机制的天然实验场。沉积物是海岸带环境中营养盐再生与转化发生的重要场所,其中多种微生物类群在氮素循环过程中扮演重要角色。本文重点介绍海岸带沉积物中固氮菌、氨氧化菌、厌氧氨氧化菌、反硝化与硝酸盐铵化微生物的基于16SrRNA基因的物种多样性和基于关键酶基因nifH、amoA、narG、nirS、nirK、nosZ、nrfA、hzo、hzs等的功能多样性;总结了在海岸带特有生境(如河口、潮间带、海草藻床、红树林、盐沼、珊瑚礁、浅海等)及污染胁迫、生物扰动等条件下各功能类群的群落组成特征及时空变化规律,并提出今后需要重点关注...
中文摘要	The coastal zone contains diverse habitats which are usually characterized by strong environmental gradients (e.g. salinity, nutrients and pollutants). This makes the coastal zone an ideal experimental laboratory for describing microbial diversity and testing hypotheses on community structure, function and control. Coastal sediment is of significance in nutrient regeneration and transformation involving different assemblages of microbes in the nitrogen cycle. This review focuses on 16S rRNA gene-based phylogenetic diversity and the key enzyme encoding gene-based (e.g. nifH, amoA, narG, nirS, nirK, nosZ, nrfA, hzo and hzs) functional diversity of nitrogen fixing, ammonia oxidizing and anaerobic ammonia oxidation (Anammox) bacteria as well as bacteria and fungi involved in denitrification and dissimilatory nitrate reduction to ammonium (DNRA). Characteristics of community composition and diversity of nitrogen cycling microbes in different habitats (e.g. estuarine, intertidal flats, seagrass or seaweed beds, mangroves, salt marsh, coral reefs, and shallow seas), and their spatiotemporal patterns under benthic pollution or bioturbation are reviewed. Future directions for a better understanding diversity of nitrogen cycling microbes are suggested,such as culture methods and technologies, and single-cell sequencing, etc.
资助机构	中科院重要方向性项目(No.KZCX2-YW-JC203;KSCX2-EW-G-12B);; 国家自然科学基金项目(No.41206155);; 山东省自然科学杰出青年基金(JQ201210)
收录类别	CSCD
CSCD记录号	CSCD:4892980
引用统计
文献类型	期刊论文
条目标识符	http://ir.yic.ac.cn/handle/133337/6390
专题	海岸带生物学与生物资源利用重点实验室_海岸带生物学与生物资源保护实验室
推荐引用方式 GB/T 7714	龚骏,宋延静,张晓黎. 海岸带沉积物中氮循环功能微生物多样性[J]. 生物多样性,2013,21(4):434-445.
APA	龚骏,宋延静,&张晓黎.(2013).海岸带沉积物中氮循环功能微生物多样性.生物多样性,21(4),434-445.
MLA	龚骏,et al."海岸带沉积物中氮循环功能微生物多样性".生物多样性 21.4(2013):434-445.

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海岸带沉积物中氮循环功能微生物多样性.p（735KB）			开放获取	CC BY-NC-SA	浏览请求全文